समझाया | ओमिक्रॉन संस्करण की उप-वंशावली

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ओमाइक्रोन के कितने अलग वंश हैं और वे एक दूसरे से कैसे भिन्न हैं?

कहानी अब तक: नवंबर 2021 के अंत में, विश्व स्वास्थ्य संगठन ने SARS-CoV-2 के वंश B.1.1.1.529 को वैरिएंट ऑफ़ कंसर्न (VoC) के रूप में नामित किया और इसे ग्रीक वर्णमाला Omicron सौंपा। इस प्रकार को शुरू में दक्षिणी अफ्रीका के जीनोम के साथ-साथ क्षेत्र के यात्रियों के आधार पर शोधकर्ताओं द्वारा उजागर किया गया था और विशेष रूप से इसके स्पाइक प्रोटीन में बड़ी संख्या में उत्परिवर्तन की विशेषता थी। 130 से अधिक देशों में अब ओमाइक्रोन संस्करण का पता चला है। वैरिएंट अब सभी सात महाद्वीपों में मौजूद है और उन क्षेत्रों में COVID-19 मामलों की वृद्धि के साथ जुड़ा हुआ है जहां इसका पता चला है, जिसमें पूरी तरह से टीका लगाए गए व्यक्तियों या ऐसे लोग शामिल हैं जो पहले SARS-CoV-2 के अन्य प्रकारों से संक्रमित थे। 2022 की शुरुआत से अधिकांश क्षेत्रों में ओमाइक्रोन महामारी पर हावी है, हालांकि कई देशों में बड़े पैमाने पर उछाल पहले ही चरम पर पहुंच चुका है।

ओमाइक्रोन की समय पर पहचान और रिपोर्टिंग दक्षिण अफ्रीका, बोत्सवाना और हांगकांग के शोधकर्ताओं के प्रयासों का परिणाम थी, जिन्होंने जीआईएसएआईडी पर संस्करण के प्रारंभिक जीनोम अनुक्रमों को साझा किया, एक डेटाबेस जिसमें दुनिया भर के शोधकर्ता सार्स के अनुक्रमण डेटा जमा करते हैं। -सीओवी-2।

वंश क्या हैं?

SARS-CoV-2 वायरस आनुवंशिक उत्परिवर्तन के संचय से विकसित होता है। ये वायरस के निरंतर विकास का आधार बनते हैं और कोशिकाओं में वायरस के संक्रमण और प्रतिकृति की प्रक्रिया के दौरान उत्पन्न होते हैं। समान जीनोमिक उत्परिवर्तन और एक सामान्य उत्पत्ति वाले वायरस के समूहों को वायरस का वंश या समूह कहा जाता है, और वंशावली का नामकरण शोधकर्ताओं द्वारा योगदान की गई एक खुली प्रणाली का पालन करता है जो पैंगो नेटवर्क बनाते हैं।

ओमाइक्रोन की उप-वंश क्या हैं?

जबकि वंश का प्रारंभिक पदनाम सिर्फ 7 जीनोम पर आधारित था, डब्ल्यूएचओ द्वारा चिंता के एक प्रकार के रूप में वंश के पदनाम में स्क्रीनिंग और अनुक्रमण की एक त्वरित गति देखी गई है और इसके परिणामस्वरूप, बड़ी संख्या में अनुक्रम प्रतिनिधि ओमिक्रॉन के प्रतिनिधि हैं। जैसे-जैसे अधिक जीनोम उपलब्ध होते गए, शोधकर्ताओं ने नोट किया कि ओमिक्रॉन के रूप में नामित सभी अनुक्रमों में उत्परिवर्तन का पूरा सेट नहीं था, जो शुरू में संस्करण के लिए रिपोर्ट किए गए थे। यह भी देखा गया कि ओमाइक्रोन क्लस्टर में न केवल एक वंश शामिल है, बल्कि एक सामान्य माता-पिता से तीन बहन वंशों का परिवार है। इन समूहों को बाद में वंशावली BA.1, BA.2 और BA.3 (जहाँ BA, B.1.1.529 के लिए एक उपनाम है) के रूप में नामित किया गया था। इस प्रकार VoC Omicron में सभी तीन उप-वंश शामिल होते हैं, हालांकि उनमें से प्रत्येक एक दूसरे से महत्वपूर्ण रूप से भिन्न होते हैं और एक दूसरे की तुलना में सामान्य और साथ ही अद्वितीय उत्परिवर्तन होते हैं।

समूहों में से, BA.1 दुनिया भर में सबसे प्रचलित ओमाइक्रोन वंश है, जो ओमाइक्रोन अनुक्रमों के 97% से अधिक के लिए जिम्मेदार है। वंश BA.2, हालांकि विश्व स्तर पर कम प्रचलित है, हाल के हफ्तों में कई क्षेत्रों में विशेष रूप से यूरोप और एशिया में सबसे अधिक बार होने वाला संस्करण बन रहा है। एशिया में, BA.1 वंश कुल ओमाइक्रोन अनुक्रमों के 85% में पाया जाता है जबकि BA.2 उनमें से 15% के लिए बनाता है। तीसरा उप-वंश, BA.3, अब तक दुर्लभ है, विश्व स्तर पर केवल कुछ सौ ज्ञात मामलों के लिए जिम्मेदार है और अभी तक एशिया से रिपोर्ट नहीं किया गया है।

BA.2 वंश क्या है और यह कैसे भिन्न है?

जैसा कि दुनिया के कई हिस्सों में COVID-19 मामलों की संख्या घट रही है, वंशावली BA.2 कई देशों में अनुपात में बढ़ रही है और पहले से प्रचलित BA.1 वंश के साथ प्रभुत्व के लिए प्रतिस्पर्धा कर रही है। कुल मिलाकर, BA.2 वंश अब 50 से अधिक देशों में पाया जाता है।

जबकि कई उत्परिवर्तन हैं जो BA.1 और BA.2 में समान हैं, वंश BA.2 में BA.1 की तुलना में 28 अद्वितीय उत्परिवर्तन हैं जो इसे अपनी बहन वंश BA.1 से सांकेतिक रूप से अलग बनाता है। यह संख्या डेल्टा (वंश बी.1.617.2) सहित किसी भी पहले से निर्दिष्ट वीओसी में परिभाषित उत्परिवर्तन की संख्या से भी अधिक है, जिसे 17 उत्परिवर्तनों के एक अद्वितीय सेट द्वारा परिभाषित किया गया है।

डेटाबेस जो प्रकाशित साहित्य से उत्परिवर्तन की कार्यक्षमता पर साक्ष्य एकत्र करते हैं, उत्परिवर्तन के कार्यों को समझने के लिए महत्वपूर्ण हैं क्योंकि वे जीनोम अनुक्रमों से स्पष्ट हो जाते हैं। ऐसा ही एक डेटाबेस -ESC (//clingen.igib.res.in/esc/) CSIR इंस्टीट्यूट ऑफ जीनोमिक्स एंड इंटीग्रेटिव बायोलॉजी में बनाए रखा जाता है और व्यवस्थित रूप से इम्यून एस्केप म्यूटेशन पर जीनोम की व्याख्या के लिए साक्ष्य एकत्र करता है।

स्पाइक प्रोटीन म्यूटेशन के संदर्भ में, BA.2 में BA.1 की तुलना में लगभग 8 अद्वितीय म्यूटेशन हैं, जिनमें से कुछ को प्रतिरक्षा से बचने के लिए जाना जाता है। हालाँकि, BA.2 में BA.1 की तुलना में कम प्रतिरक्षा से बचने की क्षमता होने की भविष्यवाणी की गई है, क्योंकि इसमें स्पाइक प्रोटीन म्यूटेशन R346K और G446S का अभाव है जो प्रमुख रूप से प्रतिरक्षा से बचने से जुड़े हैं। इसके अलावा, स्पाइक प्रोटीन के रिसेप्टर-बाइंडिंग डोमेन में उत्परिवर्तन, वायरस का प्रमुख हिस्सा जो इसे मेजबान की कोशिकाओं से जुड़ने की अनुमति देता है, बड़े पैमाने पर BA.1 और BA.2 द्वारा साझा किया जाता है।

यह ध्यान रखना महत्वपूर्ण है कि BA.1 में जीन में एक उत्परिवर्तन होता है जो स्पाइक प्रोटीन के लिए एन्कोड करता है जो कुछ RT-PCR डायग्नोस्टिक किट में उपयोग किए जाने वाले प्राइमरों में से एक को विफल कर देता है (जिसे स्पाइक जीन टारगेट फेल्योर (SGTF) के रूप में भी जाना जाता है) या स्पाइक जीन ड्रॉपआउट)। SGTF का दुनिया भर में व्यापक रूप से Omicron के लिए एक प्रॉक्सी के रूप में उपयोग किया गया था और शोधकर्ताओं को BA.1 के तेजी से प्रसार का अनुमान लगाने में सक्षम बनाया। हालांकि, BA.2 स्पाइक प्रोटीन में इस उत्परिवर्तन को परेशान नहीं करता है और इसलिए स्पाइक जीन छोड़ने का कारण नहीं बनता है। इसलिए आज व्यापकता का अनुमान बड़े पैमाने पर जीनोम अनुक्रमण के माध्यम से लगाया जाता है।

स्पाइक प्रोटीन उत्परिवर्तन के विपरीत, जीन ORF1ab में BA.1 और BA.2 के बीच उत्परिवर्तन में बड़ा अंतर है, वंश BA.2 में जीन में BA.1 की तुलना में 9 अद्वितीय उत्परिवर्तन होते हैं। वायरस में गैर-संरचनात्मक प्रोटीन के लिए ORF1ab जीन कोड जो प्रतिकृति को नियंत्रित करने, प्रूफ-रीडिंग को नियंत्रित करने और मेजबान की जन्मजात प्रतिरक्षा को बाधित करने के लिए जिम्मेदार हैं, संभवतः संचारण और रोग की गंभीरता को प्रभावित करते हैं।

BA.2 की चर्चा क्यों की जा रही है?

भारत और यूरोप सहित एशिया के कई देशों में BA.2 वंश बढ़ता हुआ देखा जा रहा है, जो इस बात का प्रारंभिक संकेत है कि वंश अपनी बहन वंश BA.1 की तुलना में अधिक संचरणीय है।

हाल के हफ्तों में कई क्षेत्रों में COVID-19 मामलों में कमी के बावजूद, BA.2 को BA.1 के साथ प्रतिस्पर्धा करते हुए देखा गया है और डेनमार्क सहित कुछ देशों में प्रमुख वंश बन गया है, जहां मामले लगातार बढ़ रहे हैं। नवंबर 2021 में डेनमार्क में BA.1 वंश का पता चला था जबकि BA.2 का पहली बार कुछ सप्ताह बाद दिसंबर में पता चला था। जनवरी 2022 के अंत तक, BA.2 ने देश में प्रमुख वंश बनने के लिए डेनमार्क में BA.1 को पछाड़ दिया है, और भारत, यूनाइटेड किंगडम, सिंगापुर, फिलीपींस और सहित कई अन्य देशों में इसकी व्यापकता बढ़ती देखी जा रही है। दक्षिण अफ्रीका।

भारत में, BA.2 को पहली बार नवंबर 2021 के अंत में, इसकी बहन वंश BA.1 का पता लगाने के 2 सप्ताह बाद पता चला था। BA.2 तब से भारत में प्रमुख ओमाइक्रोन वंश बन गया है, जो दिसंबर में सभी ओमाइक्रोन मामलों के 5% से बढ़कर जनवरी 2022 तक 50% से अधिक हो गया है। यूनाइटेड किंगडम में, BA.2 से जुड़े मामलों की संख्या में वृद्धि हुई है जनवरी 2022 के पहले सप्ताह के बाद से देखा गया। दक्षिण अफ्रीका में, जहां पहली बार ओमाइक्रोन संस्करण का पता चला था, बीए.2 हाल ही में अनुक्रमित नमूनों में प्रचलन में बढ़ रहा है, हालांकि दक्षिण अफ्रीका में ओमाइक्रोन लहर में गिरावट जारी है।

क्या BA.2 वंश अधिक पारगम्य है?

डेनमार्क में स्टेटन्स सीरम इंस्टिट्यूट द्वारा प्रारंभिक जोखिम मूल्यांकन विश्लेषण का अनुमान है कि BA.2 BA.1 की तुलना में लगभग 1.5 गुना अधिक पारगम्य है। डेनिश परिवारों में आयोजित और औपचारिक सहकर्मी समीक्षा से पहले एक प्रीप्रिंट सर्वर में जमा किए गए एक अन्य अध्ययन से पता चलता है कि BA.1 की तुलना में BA.2 संक्रमित व्यक्तियों के संपर्कों में घरेलू संचरण अधिक है, यह दर्शाता है कि BA.2 BA.1 की तुलना में आंतरिक रूप से अधिक पारगम्य है। . क्या यह प्रतिरक्षा से बचने के लिए प्रेरित है, यह अभी भी एक खुला प्रश्न है। यूके स्वास्थ्य सुरक्षा एजेंसी द्वारा सभी टीकों के लिए एक प्रारंभिक संयुक्त रिपोर्ट से पता चलता है कि रोगसूचक COVID-19 के खिलाफ टीके की प्रभावशीलता BA.2 और BA.1 वंश के लिए समान थी, हालांकि रिपोर्ट डेटा की एक छोटी मात्रा पर आधारित है और आगे के शोध होंगे वैक्सीन प्रभावकारिता को समझने के लिए आवश्यक है।

चूंकि ओमाइक्रोन पर किए गए सभी प्रारंभिक कार्य मुख्य रूप से BA.1 वंश पर केंद्रित थे, इसलिए यह देखने के लिए अतिरिक्त शोध की आवश्यकता होगी कि BA.2 वंश कैसे संबंधित है। जबकि यह दिखाने के लिए बढ़ते संकेत हैं कि BA.2 BA.1 की तुलना में अधिक प्रभावी ढंग से प्रसारित होता है, इस बात के सीमित प्रमाण हैं कि BA.2 रोग की गंभीरता के मामले में कितना भिन्न है, डेनमार्क और भारत जैसे देशों के बहुत प्रारंभिक डेटा करता है। BA.1 और BA.2 के बीच रोग की गंभीरता में पर्याप्त अंतर का सुझाव नहीं देते।

आगे क्या?

जैसा कि SARS-CoV-2 का प्रसार जारी है और बड़ी संख्या में लोगों में संक्रमण का कारण बनता है, यह स्पष्ट है कि यह उच्च गति से उत्परिवर्तन जमा करना जारी रखेगा। वर्तमान में प्रमुख वंश होने के नाते, यह उम्मीद की जाती है कि ओमाइक्रोन संस्करण के कई और उप वंश दुनिया के विभिन्न क्षेत्रों में आने की संभावना है क्योंकि वायरस अपने विकासवादी परिदृश्य की खोज करता है और डेल्टा के लिए देखा गया है। वर्तमान ओमाइक्रोन तरंग के संदर्भ में, यह आश्वस्त कर रहा है कि टीके और बूस्टर गंभीर बीमारी को रोकने में प्रभावी बने हुए हैं। क्या BA.2 पहले से BA.1 से संक्रमित लोगों में पुन: संक्रमण का कारण बन सकता है और बेरोकटोक जारी रह सकता है, यह अभी भी एक खुला प्रश्न है, साक्ष्य के अभाव में। आगामी सप्ताहों में BA.2 वंश के इर्द-गिर्द घूमने वाले अतिरिक्त शोध प्रयासों से तथ्यों का पता लगाने और इन महत्वपूर्ण सवालों के समाधान में मदद मिलेगी।

इस बीच, अनिश्चितता की अवधि में, अच्छी गुणवत्ता वाले मास्क, वेंटिलेशन और सोशल डिस्टेंसिंग सहित गैर-औषधीय हस्तक्षेप COVID-19 के खिलाफ हमारी लड़ाई में पहले से कहीं अधिक महत्वपूर्ण हो गए हैं।

लेखक दिल्ली में सीएसआईआर इंस्टीट्यूट ऑफ जीनोमिक्स एंड इंटीग्रेटिव बायोलॉजी (सीएसआईआर-आईजीआईबी) के शोधकर्ता हैं। व्यक्त सभी राय व्यक्तिगत है।

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